Работодатель может оказаться в ситуации, когда он предоставил стандартный налоговый вычет, не имея на то оснований. Например, работодатель предоставил налоговый вычет работнику, не получив от него письменного заявления, а работник, в свою очередь, получил стандартный налоговый вычет у другого налогового агента.
Бывает, что работники приносят заявления на стандартные вычеты с опозданием. Например, работник работает в организации с января 2010 г., а заявление на вычеты принес в бухгалтерию только в мае 2010 г. В такой ситуации работодатель должен сделать перерасчет налога и вернуть излишне удержанный налог (Письмо Минфина России от 14.03.2006 N 03-05-01-04/59).
Если сумма налоговых вычетов за год окажется больше суммы доходов, в отношении которых предусмотрена налоговая ставка 13%, подлежащих налогообложению за этот же год, то применительно к этому году (налоговому периоду) налоговая база принимается равной нулю (п. 3 ст. 210 НК РФ).
В течение нескольких лет спорным являлся вопрос о возможности предоставления вычетов за те месяцы налогового периода, когда у физического лица отсутствовал доход. Налоговые органы на практике, как правило, исходили из того, что вычеты предоставляются только в тех месяцах, в которых у физического лица есть доход.
Примечание. Стандартные налоговые вычеты могут предоставляться и иностранному работнику, но только в том случае, если он является налоговым резидентом РФ. Дело в том, что от того, является работник налоговым резидентом или нет, зависит налоговая ставка, по которой исчисляется и удерживается НДФЛ с его доходов.